基因检测，精准防治——liferosetta

liferosetta

产品介绍：
肿瘤个体化诊疗（Oseq™-T）是国内首个发布的通过全面检测肿瘤相关的基因，分析基因变异与药物之间的关系，协助临床医生和肿瘤患者合理使用药物的基因检测产品。

检测内容：1一次性监测肿瘤相关508个基因的外显子区域和19个基因的内含子
          2.检测所有的实体瘤
3全面、准确解读100种肿瘤药物与基因变异的关系
检测技术：目标区域捕获+高通量测序
检测优势：全面、准确、高效、专业
检测周期：10个工作日
样本类型：1癌组织样本：新鲜手术组织 石蜡组织 穿刺样本
           2 对照样本：5mL外周血
适用人群：可以去的肿瘤组织的患者。
1，        希望能够精准用药，提高疗效的患者
2，        临床常规治疗效果不佳的患者
3，        没有合适的靶向药物可用的患者

临床意义：
个体化用药：
全面检测与抗肿瘤药物相关的基因，并解读基因变异与药物的关系，为划着特别是在传统治疗方案中用药物小伙无药可用的患者找到合适的药物。
全面检测信号通路基因，为肿瘤患者寻找新的药物靶点和耐药基因
风险预测：
检测与遗传性肿瘤相关的基因，预测受检者家族家族遗传性肿瘤的风险

传统测序方法与Oseq™-T的比较
检测内容        传统方法        Oseq™-T
检测基因        少数基因的几个位点        508个基因的全部外显子
和19个基因的内含子
药物解读        仅解读少量基因与药物的关系        解读100种药物

Oseq™-T优势：
全面：
   一次检测508个基因，解读100种药物
   全面父爱与肿瘤发生、发展相关的12条信号通路的基因，检测新的药物靶点和耐药基因
准确：
   可检测频率低至1%的肿瘤基因突变
已通过ISO 15189认证的国际标准实验室
各环节严格的24项质控为准确结果保驾护航
高效：
10个工作日即可出具报告
专业：
华大特有的黄种人基因组数据库。
检测药物基因靶点的筛选源于NCCN指南、FDA和EMA

样本要求：
  Oseq™-T样本要求：
手术新鲜组织：1组织样本总量不低于60mg(黄豆大小)肿瘤细胞所占比例应大于70%，坏死细胞所占比例不能大于10%，相关的病理检测结果应保存备查。
               2低温运送。
石蜡包埋/切片组织：1切取10-15张石蜡包埋标本切片。保存时间半年以内，每张面积>10mmX10mm、厚度约5-10um，用载玻片片盒或EP管保存。如果标本过小，请酌情增加送检样品数量。
                    2常温保存、运输。
穿刺样本：1穿刺组织：不少于3针
          21.5ml EP管收集样本，半小时内置入液氮内，完全冷冻保存1小时。
          3用-80℃保存或干冰寄送。
DNA：1，DNA浓度>=30ng/ul,260/280≈1.8~2.0，总量>=3ug.
      2.-80℃保存，干冰/液氮运输。
      3，需提供DNA提取操作规程。
外周血（对照）：1 EDTA抗凝管采集5ml静脉血，严禁使用肝素抗凝。
               2收集后如寄送，低温运输。

检测技术
   依托华大自主研发的高通量测序平台，采用目标区域捕获加高通量测序的方法，对肿瘤相关基因的全部外显子进行检测。通过华大特有的黄种人基因组数据库分析基因变异与药物之间的关系，出具用药解析报告。

案例
1
患者信息        女性，48岁，非小细胞肺癌，左肺腺癌并左肺门及纵膈淋巴结转移
常规基因检测        检测EGFR和KRAS的热点突变，发现EGFR基因上有个突变L 858R，而KRAS基因2号外显子12、13号密码子无变异
选择药物        根据常规基因检测结果，患者可能对EGFR的抑制剂易瑞沙（吉非替尼）敏感。
治疗效果        口服易瑞沙两个月，无明显效果。
Oseq™-T检测        对该患者原发肿瘤组织和淋巴转移组织样本进行Oseq™-T检测，发现患者除了存在EGFR的L858R这个药物敏感突变外，在ERBB2（Her2）上亦存在Ala733Val这个激酶区突变。
推荐药物        阿法替尼
治疗效果        肺部肿块缩小，病情得到控制
案例评述        传统靶向药物检测只包含EGFR基因和KRAS基因。根据检测结果，推荐了吉非替尼（易瑞沙）作为治疗药物。
据研究报道称：ERBB2（Her2）Ala773Val突变会导致患者对于可逆的EGFR抑制剂药物具有抗药性，因此吉非替尼并不适合，而非可逆的EGFR抑制剂，如阿法替尼，适合于该患者（PMID：16397024）.



2
患者信息        女性，30岁，口腔囊性腺癌
常规基因检测        检测EGFR，KRAS，HER2，ALK几个基因，发现EGFR和HER2有阳性突变，KRAS和ALK没有变异。
选择治疗方案        EGFR阳性突变是EGFR抑制剂的有效药物靶点，根据常规基因检测结果，医生给病人选择了EGFR抑制剂易瑞沙。
治疗效果        治疗无效，病人双肺多发转移，且胸腔积液
Oseq™-T检测        对病人的肿瘤组织进行Oseq™-T检测，发现病人除了EGFR和KRAS基因发生突变外，KIT，PDGFRA，KDR基因都出现了扩增。
推荐药物        舒尼替尼
治疗效果        肿瘤得到控制，局部肿瘤坏死（如图）
案例评述        传因传统靶向药物基因检测出EGFR基因发生突变，医生给病人选用吉非替尼（易瑞沙）进行治疗，但治疗无效。
通过Oseq-T™检测病人的肿瘤组织后发现：病人除了EGFR阳性外，KRAS也发生了突变，因此或许可以解释患者服用易瑞沙无效的原因。除此以外，患者的KIT、PDGFRA和KDR出现扩增。这些基因扩增是舒尼替尼的有效药物靶点。
舒尼替尼是一个多靶点的小分子抗肿瘤药物，FDA批准用于治疗标准疗法没有响应或不能耐受的胃肠道基质肿瘤和转移性肾细胞癌，其药物主要靶点：VEGFR、C-kit、PDGFR、Flt3、RET、CSF1R。虽然病人患的是口腔癌，但是由于她携带舒尼替尼有效的药物靶点，因此服用舒尼替尼效果显著。

Oseq™-T解读药物列表
化疗药物（26）        FDA批准靶向药物（47）        临床阶段靶向药物（27）
卡铂（Carboplatin）        依维莫司(Everolimus)        Crenolanib
顺铂（Cisplatin）        替西罗莫司(Temsirolimus)        Neratinib
奥沙利铂(Oxaliplatin)        西罗莫司(Sirolimus)        Midostaurin
环磷酰胺(Cyclophosphamide)        曲妥珠单抗(Trastuzumab)        Nintedanib
异环磷酰胺(Ifosfamide)        帕唑帕尼(Pazopanib)        Ridaforolimus
柔红霉素(Daunorubicin)        硼替佐米(Bortezomib)        Linsitinib
多柔比星（Doxorubicin）        尼洛替尼(Nilotinib)        Tivantinib
表柔比星(Epirubicin)        帕妥珠单抗(Pertuzumab)        Necitumumab
伊达比星(Idarubicin)        来那度胺(Carfilzomib)        Epratuzumab
比生群(Bisantrene)        达沙替尼(Dasatinib)        Mogamulizumab
甲氨蝶呤(Methotrexate)        威罗菲尼(Vemurafenib)        Lumiliximab
卡培他滨(Capecitabine)        达拉菲尼(Dabrafenib)        Galiximab
氟尿嘧啶（5-FU）        曲美替尼(Trametinib)        Adecatumumab
阿糖胞苷(Cytarabine)        卡博替尼(Cabozantinib)        Elotuzumab
紫杉醇(Paclitaxel)        阿仑单抗(Alemtuzumab)        Farletuzumab
长春新碱(Vincristine)        西妥昔单抗(Cetuximab)        Ocrelizumab
多西他赛(Docetaxel)        贝伐单抗(Bevacizumab)        Quizartinib
依托泊苷(Etoposide)        普纳替尼(Ponatinib)        Triciribine
吉西他滨(Gemcitabine)        凡德他尼(Vandetanib)        AP26113
他莫昔芬(Tamoxifen)        利妥昔单抗(Rituximab)        AZD4547
来曲唑(Letrozole)        帕尼单抗(Panitumumab)        MEK162
阿那曲唑(Anastrozole)        博舒替尼(Bosutinib)        NVP-TAE684
伊立替康(Irinotecan)        克唑替尼(Crizotinib)        PR81
巯嘌呤(Mercaptopurine)        伊马替尼(Imatinib)        R1507
巯唑嘌呤(Azathioprine)        瑞戈非尼(Regorafenib)        SU5614
巯鸟嘌呤(Thioguanine)        厄洛替尼(Erlotinib)        WZ4002
        吉非替尼(Gefitinib)        XI888
        阿法替尼(Afatinib)       
        拉帕替尼(Lapatinib)       
        舒尼替尼(Sunitinib)       
        索拉菲尼(Sorafenib)       
        维莫德吉(Vismodegib)       
        鲁索利替尼(Ruxolitinib)       
        雷莫芦单抗(Ramucirumab)       
        阿西替尼(Axitinib)       
        色瑞替尼(Ceritinib)       
        依鲁替尼(Ibrutinib)       
        乐伐替尼(Lenvatinib)       
        伏立诺他(Vorinostat)       
        奥拉帕尼(Olaparib)       
        尼伏单抗(Nivolumab)       
        帕博西林(Palbociclib)       
        派姆单抗(Pembrolizumab)       
        Obinutuzumab       
        Ado-trastuzumab       
        Alectinib